黄海（杜汶泽 饰）在日本借巨额高利贷做本钱经营皮条生意，结果中计导致血本无归。黄海无奈只得在新宿街头扒窃，机缘巧合偷到了小学同学——轻度弱智的李子俊（黎明 饰）头上。李子俊随大哥到日本，不幸与其失散，

由于两年前揭发同僚贪污，台北警官黄火土（梁家辉）被上级报复调入冷门的外事组工作，利益也曾连带受损的新同事对他怒言相向，加上妻子清芳（刘若英）受不了他长期不回家要求离婚，黄火土感觉他的世界正在逐渐四分五裂。　　就在此时，三宗受害者的身份并无关联的震惊了台湾社会的离奇命案发生，法医（杨贵媚）验尸发现他们都是因中一种神秘的黑霉菌产生幻觉而死，因为缺乏此方面的人才，当局从美国请来此种案例的侦办专家凯文莱特（David Morse）协助破案，黄火土重被任用。随着一桩令所有人都目瞪口呆的事实的被发现，一场围绕政治